Primer Premier(引物設(shè)計(jì)軟件) v6.24

Primer Premier 6是加拿大Premier公司推出的一款專業(yè)的引物設(shè)軟件，軟件主體分為四大部分，尤其常用的是引物設(shè)計(jì)、限制性內(nèi)切酶位點(diǎn)分析和DNA基元（motif）查找，給專業(yè)人員帶來(lái)的極大的便利。

小編為大家?guī)?lái)的Primer Premier 6.24最新版本功能更加強(qiáng)大，立足點(diǎn)也是按照引物設(shè)計(jì)的基本原則，只是更加快速和自動(dòng)化而已。我們可以直接提交模板序列到特定網(wǎng)頁(yè)，如著名的primer3，得到設(shè)計(jì)好的引物，也可以在本地計(jì)算機(jī)上運(yùn)行引物設(shè)計(jì)專業(yè)軟件，支持win7 操作系統(tǒng)，具有PCR或測(cè)序引物以及雜交探針設(shè)計(jì)功能，有需要的朋友請(qǐng)下載體驗(yàn)。

軟件功能

1、CR引物設(shè)計(jì)：設(shè)計(jì)引物對(duì)用于PCR和多重實(shí)驗(yàn)。

2、跨物種：擴(kuò)增來(lái)自多個(gè)物種的序列。

3、致病性檢測(cè)：在高度保守的區(qū)域中定位寡核苷酸。

4、等位基因特異性：僅擴(kuò)增一組相關(guān)序列中的單個(gè)成員。

5、簡(jiǎn)并：從氨基酸序列開(kāi)始，反向翻譯并自動(dòng)設(shè)計(jì)低簡(jiǎn)并區(qū)域的寡核苷酸。

6、嵌套/多重：檢查多個(gè)候選寡核苷酸之間的同源性。

7、限制酶和基序分析：從數(shù)據(jù)庫(kù)中選擇800多種酶和200種常見(jiàn)基序。

8、Clustal W比對(duì)：使用任何資源（包括EBI）在執(zhí)行ClustalW比對(duì)后加載比對(duì)序列。

9、多序列比對(duì)：使用流行的Clustal W算法來(lái)對(duì)齊桌面上的序列（僅適用于Windows版本）。

10、算法：使用Breslauer值計(jì)算Tm。

長(zhǎng)PCR-處理最多50 KB的序列。

軟件特色

1、主要界面可分為序列編輯窗口（Genetank），引物設(shè)計(jì)窗口（Primer Design），酶切分析窗口（Restriction Sites）和紋基分析窗口（Motif）四大塊

2、該軟件就是用來(lái)進(jìn)行引物設(shè)計(jì)的，進(jìn)行這些操作非常簡(jiǎn)單

3、可以簡(jiǎn)單地通過(guò)手動(dòng)拖動(dòng)鼠標(biāo)以擴(kuò)增出相應(yīng)片段所需的引物

4、在手動(dòng)的任何時(shí)候，下面顯示各種參數(shù)的改變和可能的二聚體、異 二聚體、發(fā)夾結(jié)構(gòu)等。也可以給定條件，讓軟件自動(dòng)搜索引物，并將引物分析結(jié)果顯示出來(lái)

primer6設(shè)計(jì)引物教程

1、首先，選取目的基因序列，對(duì)格式?jīng)]有什么要求，只需要將目的基因序列復(fù)制就可以。

2、打開(kāi)File目錄下的New，選擇Sequence。這里的另一個(gè)project選項(xiàng)是導(dǎo)入文件的方式，也就是將目的基因以文件形式保存的可以直接導(dǎo)入文件。一般通過(guò)復(fù)制的方式會(huì)更方便。

3、打開(kāi)Sequence后，會(huì)彈出粘貼框，只需要將剛剛復(fù)制的基因序列粘貼上即可，然后點(diǎn)擊下方的Add。

4、選擇上方的紅藍(lán)雙向箭頭的按鈕進(jìn)行引物設(shè)計(jì)，在設(shè)計(jì)開(kāi)始前可以更改設(shè)計(jì)的參數(shù)，包括搜索的堿基范圍、引物的長(zhǎng)度，堿基數(shù)，設(shè)計(jì)結(jié)果顯示的引物對(duì)數(shù)等。

5、設(shè)置完參數(shù)后，點(diǎn)擊下方的Search，軟件開(kāi)始分析設(shè)計(jì)，完成后，點(diǎn)擊OK。設(shè)計(jì)結(jié)果就會(huì)在下面顯示出來(lái)。

6、結(jié)果中藍(lán)色為前引物，紅色為后引物，Rating是對(duì)引物的綜合評(píng)價(jià)分?jǐn)?shù)，在上方也會(huì)顯示引物的優(yōu)劣，最好的為Best，中等為Good，最次的為Poor。一般選擇引物都為Best或Good，其它顯示均是無(wú)法使用的。

7、在右邊還有兩個(gè)選項(xiàng)，All Primers可以查看可選擇的多對(duì)不同引物?？梢愿鶕?jù)需要選擇合適位置和適當(dāng)產(chǎn)物長(zhǎng)度的引物。選擇后需要點(diǎn)擊下方的Replace才能替換。

8、All Structers則可以查看當(dāng)前選定引物的結(jié)構(gòu)，如發(fā)夾結(jié)構(gòu)，引物二聚體和重復(fù)堿基等。

9、引物選定完成后，點(diǎn)擊下方的引物序列，再右鍵會(huì)彈出復(fù)制信息選項(xiàng)，進(jìn)而將設(shè)計(jì)好的引物導(dǎo)出。也可以直接以文件的形式將結(jié)果導(dǎo)出。