FastPCR是一款簡單易用,功能強大的PCR引物設(shè)計軟件。它為用戶提供了一個集成的工具環(huán)境,為設(shè)計任何類型的PCR引物提供全面而專業(yè)的設(shè)計輔助工具,可用于分析硅片,pcr集成工具環(huán)境,PCR引物或探針設(shè)計等場合,包括各種生物信息學(xué)工具,還具備處理長序列和核酸或蛋白質(zhì)序列組的能力,功能非常豐富,有需求的用戶請下載安裝!
軟件功能
1、FastPCR軟件是一個集成的工具環(huán)境,為設(shè)計任何類型的PCR引物提供全面而專業(yè)的設(shè)施,用于標(biāo)準(zhǔn),長距離,反向,實時PCR(LUX和自我報告),多重PCR,Xtreme Chain Reaction(XCR),組特異性(用于遺傳相關(guān)DNA序列的通用引物)或獨特的(來自遺傳相關(guān)DNA序列的特異性引物),重疊延伸PCR(OE-PCR)多片段組裝克隆和LAMP(環(huán)介導(dǎo)的等溫擴增); 單引物PCR(從密切定位的反向重復(fù)序列設(shè)計PCR引物),自動檢測SSR基因座和直接PCR引物設(shè)計,氨基酸序列簡并PCR,聚合酶鏈裝配(PCA),平鋪感興趣區(qū)域的設(shè)計擴增子以及更多。
2、“ 計算機模擬”(虛擬)PCR引物或針對全基因組的探針?biāo)阉骰蛴嬎銠C模擬PCR或可能的PCR產(chǎn)物的染色體預(yù)測列表以及搜索指定引物或探針的潛在錯配位置。在一定范圍內(nèi)同時搜索多個目標(biāo)?!?in silico ”寡核苷酸搜索有助于通過溫度熔解和PCR退火溫度計算發(fā)現(xiàn)靶結(jié)合位點。
3、可以設(shè)計長寡核苷酸用于微陣列分析,并且可以設(shè)計用于探針的雙標(biāo)記寡核苷酸,例如分子信標(biāo)。
軟件亮點
1、綜合引物測試,標(biāo)準(zhǔn)和簡并寡核苷酸的熔解溫度計算,引物的PCR效率和語言復(fù)雜性,稀釋和重懸浮計算器。
2、分析所有引物二級結(jié)構(gòu)的引物(探針),包括與Watson-Crick堿基配對的替代氫鍵,例如G / C-四鏈體或擺動堿基對(如GG,GT,GA),發(fā)夾,自身二聚體和交叉 - 引物對中的二聚體。該軟件利用所有工具的正常和簡并引物的組合,并且用于熔解溫度計算基于最近鄰熱力學(xué)參數(shù)。
3、FastPCR具有處理長序列和核酸或蛋白質(zhì)序列組的能力,它允許每個給定序列的單個任務(wù)和參數(shù),并連接單個運行的幾個不同任務(wù)。它還允許序列編輯和數(shù)據(jù)庫分析。
4、通過可視化開發(fā)并應(yīng)用于程序的各種類型重復(fù)的高效和完整檢測。
5、該程序包括各種生物信息學(xué)工具,用于分析具有GC或AT偏斜的序列,CG%和GA%含量和嘌呤 - 嘧啶偏斜,語言序列復(fù)雜性; 生成隨機DNA序列,限制性I-II-III類型酶和歸巢核酸內(nèi)切酶分析,找到或創(chuàng)建編碼序列的限制酶識別位點,并支持序列聚類和共有序列生成以及序列相似性和保守性分析。
系統(tǒng)要求
系統(tǒng)需求:Microsoft Windows 10/8/7 / Vista / 2003 / XP(32位(x86)或64位(x64)
內(nèi)存:2 GB RAM
顯示:最低屏幕分辨率為1280x800
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